Принципиальный вопрос.

Все современные аквариумы оснащаются системой биологической фильтрации. Смысл её заключается в том, что аквариумная вода циркулирует через очень пористый субстрат, поверхность пор которого населена бактериями, перерабатывающими продукты жизнедеятельности гидробионтов в неопасные химические соединения.

Существует два популярных способа организовать такую систему:

1 вариант.  

Вода качается под напором через плотно закрытую ёмкость с наполнителями. По этому принципу работают все внешние фильтры заводского производства (мы рекомендуем EHEIM). Недостатком такой системы можно считать быструю гибель бактерий при непредвиденном отключении эл. питания в сети, а при его включении, выброс отфильтрованного материала в аквариум.

2 вариант.

Вода  из аквариума самотеком сливается в биофильтр, проходит через слой наполнителя  и собирается в емкости, откуда очищенная вода откачивается насосом обратно в аквариум.В таком фильтре слои наполнителя находятся выше уровня воды, которая, стекая по пористым гранулам, создаёт оптимальную среду для аэробных бактерий. Такое устройство аквасистемы незаменимо при установке многочисленного оборудования для поддержания жизни в коралловом рифе. Недостатком(?) этого варианта является его (кажущаяся) сложность.